Д-р Михаил Калнев извършва пълния спектър от планови и спешни неврохирургични манипулации, като специализира в лечението на мозъчносъдови заболявания (включително тромбектомия при исхемичен инсулт, аневризми и малформации) и травматични състояния (евакуация на всички видове интракраниални хематоми, импресионни фрактури и екстирпация на чужди тела). В областта на гръбначната хирургия прилага минимално инвазивен достъп при дискови хернии, спинална стеноза и спондилолистези, както и предна/задна стабилизация при травми на шийния, торакалния и лумбалния отдел. В невроонкологията извършва премахване на тумори на главния и гръбначния мозък и стълб, включително сложни хипофизарни, параселарни и понтоцеребеларни тумори, използвайки оперативен микроскоп и невронавигация. Дейността му обхваща още хирургия на вродени заболявания (хидроцефалия, краниостенози) и операции на нервни плексуси и периферни нерви при травми.